MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 1635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	TTC	2	6	94	99	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707623
2	NC_017665	TGT	2	6	103	108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707623
3	NC_017665	AT	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	386707623
4	NC_017665	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707623
5	NC_017665	CCA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707623
6	NC_017665	TCT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707623
7	NC_017665	TCA	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707623
8	NC_017665	GTT	2	6	428	433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707623
9	NC_017665	CCTCT	2	10	568	577	0 %	40 %	0 %	60 %	386707623
10	NC_017665	GCT	2	6	606	611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707623
11	NC_017665	GAT	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707623
12	NC_017665	TCA	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707623
13	NC_017665	T	6	6	908	913	0 %	100 %	0 %	0 %	386707624
14	NC_017665	GC	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	386707624
15	NC_017665	AGCA	2	8	1120	1127	50 %	0 %	25 %	25 %	386707624
16	NC_017665	AGC	3	9	1135	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707624
17	NC_017665	TGC	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707624
18	NC_017665	GAT	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707624
19	NC_017665	CAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707624
20	NC_017665	AGT	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707624
21	NC_017665	CAG	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707625
22	NC_017665	T	6	6	1498	1503	0 %	100 %	0 %	0 %	386707625
23	NC_017665	CAG	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707625
24	NC_017665	CCG	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707625
25	NC_017665	TTA	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707625
26	NC_017665	TCGC	2	8	1872	1879	0 %	25 %	25 %	50 %	386707625
27	NC_017665	A	7	7	1907	1913	100 %	0 %	0 %	0 %	386707625
28	NC_017665	CCG	2	6	2026	2031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707626
29	NC_017665	CG	3	6	2235	2240	0 %	0 %	50 %	50 %	386707626
30	NC_017665	AAG	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707627
31	NC_017665	ACC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707627
32	NC_017665	ACG	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707627
33	NC_017665	CGC	2	6	2363	2368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707627
34	NC_017665	ATG	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
35	NC_017665	CGG	2	6	2438	2443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707627
36	NC_017665	TTG	2	6	2495	2500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707627
37	NC_017665	ACC	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707627
38	NC_017665	GTTAC	2	10	2628	2637	20 %	40 %	20 %	20 %	386707627
39	NC_017665	GGC	2	6	2643	2648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707627
40	NC_017665	AGC	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707627
41	NC_017665	CTGG	2	8	2745	2752	0 %	25 %	50 %	25 %	386707627
42	NC_017665	TGA	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
43	NC_017665	GCT	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707627
44	NC_017665	ATG	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
45	NC_017665	GCT	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707627
46	NC_017665	TGG	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386707627
47	NC_017665	GCTG	2	8	3024	3031	0 %	25 %	50 %	25 %	386707627
48	NC_017665	GCA	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707627
49	NC_017665	TGA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
50	NC_017665	AGGA	2	8	3098	3105	50 %	0 %	50 %	0 %	386707627
51	NC_017665	GAA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707627
52	NC_017665	TCAC	2	8	3212	3219	25 %	25 %	0 %	50 %	386707627
53	NC_017665	TGA	2	6	3220	3225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
54	NC_017665	GGC	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707628
55	NC_017665	AGG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386707628
56	NC_017665	GAA	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707628
57	NC_017665	TGA	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707628
58	NC_017665	CA	3	6	3475	3480	50 %	0 %	0 %	50 %	386707629
59	NC_017665	TGA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707629
60	NC_017665	GCA	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707629
61	NC_017665	TCC	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386707629
62	NC_017665	TGA	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
63	NC_017665	CTG	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
64	NC_017665	CAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707630
65	NC_017665	GC	3	6	4448	4453	0 %	0 %	50 %	50 %	386707630
66	NC_017665	TCG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
67	NC_017665	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707630
68	NC_017665	TGA	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
69	NC_017665	TGA	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
70	NC_017665	CAGC	2	8	4654	4661	25 %	0 %	25 %	50 %	386707630
71	NC_017665	TGA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
72	NC_017665	CCA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707630
73	NC_017665	TGAT	2	8	4758	4765	25 %	50 %	25 %	0 %	386707630
74	NC_017665	AAT	2	6	4799	4804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707630
75	NC_017665	GTC	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
76	NC_017665	ATT	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707630
77	NC_017665	CTG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
78	NC_017665	CTG	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
79	NC_017665	AGC	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707630
80	NC_017665	GTT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707630
81	NC_017665	TTG	2	6	5091	5096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707630
82	NC_017665	ATT	2	6	5111	5116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707630
83	NC_017665	TTG	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707631
84	NC_017665	CCTG	2	8	5271	5278	0 %	25 %	25 %	50 %	386707631
85	NC_017665	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707631
86	NC_017665	CGG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707631
87	NC_017665	T	6	6	5325	5330	0 %	100 %	0 %	0 %	386707631
88	NC_017665	AAT	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707631
89	NC_017665	TC	3	6	5366	5371	0 %	50 %	0 %	50 %	386707631
90	NC_017665	TCA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707631
91	NC_017665	AGC	2	6	5523	5528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707631
92	NC_017665	TCA	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707631
93	NC_017665	T	6	6	5562	5567	0 %	100 %	0 %	0 %	386707631
94	NC_017665	AGTG	2	8	5809	5816	25 %	25 %	50 %	0 %	386707632
95	NC_017665	AAGA	2	8	5827	5834	75 %	0 %	25 %	0 %	386707632
96	NC_017665	TC	3	6	5877	5882	0 %	50 %	0 %	50 %	386707632
97	NC_017665	A	6	6	5906	5911	100 %	0 %	0 %	0 %	386707632
98	NC_017665	GCA	2	6	5954	5959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707632
99	NC_017665	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707632
100	NC_017665	TGTT	2	8	6039	6046	0 %	75 %	25 %	0 %	386707632
101	NC_017665	TTG	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707632
102	NC_017665	TTCG	2	8	6194	6201	0 %	50 %	25 %	25 %	386707633
103	NC_017665	ATGAC	2	10	6232	6241	40 %	20 %	20 %	20 %	386707633
104	NC_017665	TCT	3	9	6261	6269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707633
105	NC_017665	AAC	2	6	6280	6285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386707633
106	NC_017665	TTG	2	6	6310	6315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707633
107	NC_017665	GGCA	2	8	6466	6473	25 %	0 %	50 %	25 %	386707633
108	NC_017665	TGCC	2	8	6728	6735	0 %	25 %	25 %	50 %	386707633
109	NC_017665	ATCGT	2	10	6799	6808	20 %	40 %	20 %	20 %	386707633
110	NC_017665	A	7	7	6857	6863	100 %	0 %	0 %	0 %	386707633
111	NC_017665	TCG	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707633
112	NC_017665	GATG	2	8	7001	7008	25 %	25 %	50 %	0 %	386707633
113	NC_017665	CCT	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386707633
114	NC_017665	A	7	7	7080	7086	100 %	0 %	0 %	0 %	386707633
115	NC_017665	A	6	6	7183	7188	100 %	0 %	0 %	0 %	386707633
116	NC_017665	GCA	2	6	7208	7213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707633
117	NC_017665	GTC	2	6	7222	7227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707633
118	NC_017665	GCT	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707633
119	NC_017665	TGG	2	6	7436	7441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386707633
120	NC_017665	GTC	2	6	7501	7506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707633
121	NC_017665	AAAG	2	8	7602	7609	75 %	0 %	25 %	0 %	386707633
122	NC_017665	GAA	2	6	7650	7655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707633
123	NC_017665	CA	3	6	7661	7666	50 %	0 %	0 %	50 %	386707633
124	NC_017665	ACA	2	6	7730	7735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386707633
125	NC_017665	TTG	2	6	7744	7749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707633
126	NC_017665	CAG	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707633
127	NC_017665	CAG	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707633
128	NC_017665	TTTG	2	8	7865	7872	0 %	75 %	25 %	0 %	386707633
129	NC_017665	GCTG	2	8	7907	7914	0 %	25 %	50 %	25 %	386707633
130	NC_017665	CAG	2	6	7934	7939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707633
131	NC_017665	TGC	2	6	7954	7959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707633
132	NC_017665	TCA	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707633
133	NC_017665	CA	3	6	8104	8109	50 %	0 %	0 %	50 %	386707633
134	NC_017665	GAT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707633
135	NC_017665	AGA	2	6	8198	8203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707633
136	NC_017665	GCT	2	6	8283	8288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707633
137	NC_017665	GCT	2	6	8301	8306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707633
138	NC_017665	ACG	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707633
139	NC_017665	AGA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707633
140	NC_017665	GTT	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707633
141	NC_017665	TAT	2	6	8584	8589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707633
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143	NC_017665	ATC	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707633
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145	NC_017665	CTA	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707633
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148	NC_017665	GGTT	2	8	8915	8922	0 %	50 %	50 %	0 %	386707634
149	NC_017665	T	7	7	8921	8927	0 %	100 %	0 %	0 %	386707634
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152	NC_017665	TCG	2	6	9081	9086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707634
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157	NC_017665	GCT	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707634
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162	NC_017665	CGG	2	6	9635	9640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707634
163	NC_017665	TAC	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707634
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169	NC_017665	TGT	2	6	10159	10164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707634
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241	NC_017665	AAAT	2	8	14246	14253	75 %	25 %	0 %	0 %	386707637
242	NC_017665	G	7	7	14381	14387	0 %	0 %	100 %	0 %	386707637
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247	NC_017665	A	6	6	14545	14550	100 %	0 %	0 %	0 %	386707637
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253	NC_017665	CCA	2	6	15540	15545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707639
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255	NC_017665	ATT	2	6	15607	15612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707639
256	NC_017665	CAGA	2	8	15834	15841	50 %	0 %	25 %	25 %	386707640
257	NC_017665	GAT	2	6	15889	15894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707640
258	NC_017665	AAT	2	6	15953	15958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707640
259	NC_017665	ATA	2	6	15998	16003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707640
260	NC_017665	TG	3	6	16261	16266	0 %	50 %	50 %	0 %	386707641
261	NC_017665	TAC	2	6	16288	16293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707641
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263	NC_017665	AT	3	6	16358	16363	50 %	50 %	0 %	0 %	386707641
264	NC_017665	T	6	6	16375	16380	0 %	100 %	0 %	0 %	386707641
265	NC_017665	ATG	2	6	16401	16406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707641
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500	NC_017665	TTCA	2	8	30302	30309	25 %	50 %	0 %	25 %	386707655

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